Kakao hævet skudvirus

Cacao opsvulmet-skyd-virus (CSSV) er en tidligere virus arter fra familien af Caulimoviridae , som nu er internationale udvalg for Taksonomi af virus blev delt (ICTV) i syv arter. Sammen med ca. 23 andre plantevira udgør disse slægten Badnavirus . De inficerer kakaotræet ( Theobroma cacao ) som den eneste vært og overføres af hvidblå (Pseudococcidae) ved at suge saften. Disse virusarter er hidtil kun fundet i vestafrikanske kakaoplantager, overvejende i Ghana , Togo og Nigeria . Plantedød fra CSSV-infektion og hurtig spredning inden for en plantage er en væsentlig økonomisk trussel mod kakaodyrkning .

I 1963 blev en CSSV præsenteret for første gang som en stavformet, ikke-indhyllet virus og identificeret som det forårsagende middel til kakaotræets mosaiksygdom. Et CSSV- genom blev først karakteriseret i 1991; den består af et cirkulært, dobbeltstrenget DNA , hvoraf nogle har enkeltstrengede regioner. Genomet er ved hjælp af en omvendt transkriptase af en RNA- genereret forløber, hvorfor CSSV eller Badnavirus de virkelige retrovirus lukker sig.

Systematik

Fra marts 2019 bekræftede ICTV følgende CSSV-arter:

• Slægt Badnavirus

• Arter Cacao hævet skyde-CD-virus (CSSCDV)
• Arter Cacao hævet skyde CE-virus (CSSCEV)
• Arter Cacao hævet skud Ghana M-virus (CSSGMV)
• Arter Cacao hævet skud Ghana N-virus (CSSGNV)
• Arter Cacao hævet skud Ghana Q-virus (CSSGQV)
• Arter Cacao hævet skyde Togo A-virus (CSSTAV)
• Arter Cacao hævet skud Togo B-virus (CSSTBV) med folkeafstemning Agou1-93

Derudover er der andre foreslåede, endnu ubekræftede arter, såsom:

• Arter Cacao hævet skyde Ghana J-virus (CSSGJV)
• Arter Cacao hævet skyde Ghana K-virus (CSSGKV)
• Arter Cacao hævet skyde Ghana L-virus (CSSGLV)
• Arter Cacao hævet skyde Ghana P-virus (CSSGPV)
• Arter Cacao hævet skud Ghana R-virus (CSSGRV)
• Arter Cacao hævet skyde Ghana S-virus (CSSGSV)
• Arter Cacao hævet skyde Ghana T-virus (CSSGTV)

De foreslåede arter S og T har indtil videre (pr. 2017) kun ufuldstændigt dekodet genomer.

morfologi

De ikke-indhyllede viruspartikler (virioner) af CSSV-arterne er stavformede (" bacilliform ") og ensartede 30 nm brede; dens længde er i gennemsnit 130 nm, men varierer mellem 60 og 900 nm. Baseret på en icosahedrisk symmetri af kapsiden skabes den aflange form ved gentagne gange indsatte ringe af hexamerer, der skaber en aflang, ikke-isometrisk icosahedron.

Genom

Genomet af arten CSSTBV har ca. 7161 bp (referencestamme Agou1) og indeholder sandsynligvis fem åbne læserammer ( engelske åbne læserammer , ORF'er) 1, 2, 3, X og Y, som alle er placeret på plusstrengen er af dobbeltstrenget DNA-genom. ORF'erne 1 og 2 koder for proteiner med ukendt funktion, idet ORF 2 er et DNA-bindende protein. Genproduktet fra ORF 3 (211  kDa ) kan opdeles i tre forskellige regioner, hvor region 1 koder for et protein, der er vigtigt for den direkte spredning af virussen mellem celler. Region 2-produktet er det virale kapsidprotein. Endelig har region 3 de strukturelle egenskaber af en DNA- polymerase , revers transkriptase og RNase H , som er typiske for pararetrovira. ORF'er X og Y (13 og 14 kDa) overlapper ORF 3 og er ikke til stede i nogen anden art af slægten Badnavirus beskrevet . Som med andre Caulimoviridae har CSSV en lignende genomorganisation som de indhyllede Hepadnaviridae hos dyr.

sygdom

CSSV-arterne er kun i stand til at inficere kakaoplanten eksperimentelt. Som alle vira af de Badnavirus slægten , behøver det CSSV ikke inficere alle celler i værtsplanten, men er begrænset til celler i vaskulære bundt . CSSV-virioner kan hovedsageligt observeres i ledsagende celler i bladfloemet og mindre i cellerne i xylem . Efter en inkubationsperiode på 4 til 7 uger vises symptomerne på infektionen på planten, der oprindeligt påvirker bladene. Den senere typiske hævelse af bagagerummet og unge skud ( skyde hævelse ) er baseret på overdreven, regenerativ vækst af barken og bundterne af linjer i bagagerummet og bliver synlig efter 8-11 uger. En sygdom hos plantagerplanter kan påvises på et tidligt stadium (6 til 20 dage efter infektion) ved hjælp af polymerasekædereaktionen .

litteratur

• R. Hull et al.: Slægt Badnavirus . I: CM Fauquet, MA Mayo et al.: Ottende rapport fra den internationale komité for virataksonomi . London / San Diego 2005, s. 392 f.

Weblinks

• EM-billede af CSSV i et urtepræparat
• Art CSSV i ICTV- databasen
• Reference sekvens af CSSV
• CSSV-taksonomiside. NCBI

Individuelle beviser

1. ↑ ^{a b c d} ICTV: ICTV-taksonomihistorie: Commelina yellow mottle virus , EC 51, Berlin, Tyskland, juli 2019; Ratificering af e-mail marts 2020 (MSL # 35)
2. ^ AA Brunt, RH Kenten: Anvendelsen af ​​protein til ekstraktion af kakaosvulmet skudvirus fra kakaoblade . I: Virology , 1963, 19, s. 388-392, PMID 14016365
3. ↑ Hervé Lot, Edem Djiekpor, Mireille Jacquemond: Karakterisering af genomet af kakao hævet skudvirus . I: J. General Virology , 1991, 72, 7, s. 1735-1739, PMID 1856700 ; microbiologyresearch.org (PDF; 6,1 MB) med et elektronmikroskopbillede af CSSV
4. ↑ ICTV : Master Species List 2018b.v2 , MSL # 34 fra marts 2019
5. ↑ Ervín Muller, Sammy Sackey: Molekylær variabilitetsanalyse af fem nye komplette kakao-opsvulmede genomiske sekvenser , i: Archives of Virology 150 (1), s. 53-66, februar 2005, doi: 10.1007 / s00705-004-0394- 8. plads
6. ↑ Emmanuelle Muller: Oprettelse af 4 nye arter i slægten Badnavirus , ICTV-forslag 2015.026aP
7. ↑ ^{a b c d} E. Muller, S. Ravel, C. Agret, F. Abrokwah, H. Dzahini-Obiatey, I. Galyuon, K. Kouakou, EC Jeyaseelan, J. Allainguillaume, A. Wetten: Næste generations sekventering belyser cacao badnavirus mangfoldighed og afslører eksistensen af ​​mere end ti virale arter , i: Virus Research 2017, doi: 10.1016 / j.virusres.2017.11.019
8. ↑ NCBI: Cacao hævet skyde Ghana J-virus (art)
9. ↑ NCBI: Cacao hævet skyde Ghana K-virus (art)
10. ↑ NCBI: Cacao hævet skyde Ghana L-virus (art)
11. ↑ NCBI: Cacao hævet skyde Ghana P-virus (art)
12. ↑ NCBI: Cacao hævet skud Ghana R-virus (art)
13. ↑ NCBI: Cacao hævet skud Ghana S-virus (art)
14. ↑ NCBI: Cacao hævet skyde Ghana T-virus (art)
15. ↑ E. Jacquot et al.: Det åbne læseramme 2-produkt af kakaosvulmet skyde-badnavirus er et nukleinsyrebindende protein . I: Virology , 1996, 225, 1, s. 191-195, PMID 8918546
16. ↑ LS Hagen, M. Jacquemond et al.: Nukleotidsekvens og genomisk organisering af kakaosvulmet skydevirus . I: Virology , 1993, 196.2, s. 619-628, PMID 7690503
17. ↑ E. Jacquot, LS Hagen et al. : In situ lokalisering af kakaosvulmet skydevirus i agroinficeret Theobroma-kakao . I: Archives of Virology , 1999, 144.2, s. 259-271, PMID 10470252
18. ↑ E. Müller, E. Jacquot, P. Yot: Tidlig påvisning af kakaosvulmet skydevirus ved hjælp af polymerasekædereaktionen . J. Virol. Metoder. (2001) 93, 1-2: s. 15-22 PMID 11311339