Zoller sluttede sig til Salzburger Landesskiverband i en alder af elleve. Lige fra starten koncentrerede han sig om de tekniske discipliner slalom og kæmpeslalom. Han blev senere optaget i ungdomsholdet fra det østrigske skiforbund, og efter et par år i C- og B-holdene blev han forfremmet til A-holdet i begyndelsen af 1980'erne. Han gjorde sin første optræden i verdensmesterskabet den 5. januar 1978 i Oberstaufen slalom . Indtil videre nåede han ikke pointene i sine få verdensmesterskaber. I Europacupen opnåede han sine to første sejre i slalom i Mellau og storslalom Villach i sæsonen 1980/81 . I den næste vinter fejrede han to sejre i de to europacup - slalomer af Mehlmeisel og kom dermed ind i ÖSV-landsholdet. I det meste af sæsonen 1982/83 faldt han imidlertid ud på grund af en alvorlig knæskade (sikkerhedsstillelse og korsbåndsrivning), som han led under træning.
I vinteren 1983/84 kom Zoller også til toppen i verdensmesterskabet. Den 20. december 1983, med det høje startnummer 38, nåede han andenpladsen i slalom af 3-træs løb i Madonna di Campiglio bag svensken Ingemar Stenmark og vandt dermed sine første verdensmesterskabspoint. Imidlertid lykkedes det ham ikke at blive med i holdet til vinter-OL i februar 1984. To uger efter de ubesvarede spil vandt han sit første og eneste verdensmesterskabsløb i Vail Slalom, og en sjette slalomrang fulgte i Oslo i slutningen af marts og bragte ham til ottende plads i Slalom-verdensmesterskabet i sæsonen 1983/84. I sæsonen 1984/85 opnåede Zoller tre top 10-placeringer i december og januar i slalomerne Sestriere , Madonna di Campiglio og Wengen , hvilket sikrede ham en startplads ved verdensmesterskabet i Bormio i 1985 . Der vandt han bronzemedaljen i slalom bag svensken Jonas Nilsson og Marc Girardelli, der startede for Luxembourg . I slutningen af sæsonen, med tredjepladsen i Heavenly Valley- slalommen, lykkedes han også en podiumplads i verdensmesterskabet og blev bundet til 12. i Slalom-verdensmesterskabet med italienske Alex Giorgi . I sæsonen 1985/86 kunne Zoller ikke helt matche det foregående års resultater på grund af skade. Hans bedste resultat var syvende i Lillehammer slalom . I slutningen af vinteren trak han sig tilbage fra verdensmesterskabet og deltog i professionelle løb indtil 1989. Zoller afsluttede sin uddannelse som statscertificeret skiinstruktør og overtog ledelsen af en af de to skiskoler i Mühlbach am Hochkönig. Han arbejder også som træner i Hugo Nindls Austria Racing Camps .