Zoecke blev en professionel tennisspiller i 1989 og vandt samme år single- titlen på Challenger-turneringen i Rümikon og den dobbelte titel sammen med Libor Pimek . Det følgende år vandt han Challenger-turneringen i München med Jens Woehrmann , hvor han blev elimineret i semifinalen i singler. I 1991 vandt han Taipei Challenger Tournament . I de følgende år deltog han også i flere semifinaler på ATP World Tour . I 1994 vandt han sin eneste ATP-titel i Sun City, Sydafrika . Det følgende år vandt han sin eneste dobbelte titel på ATP World Tour sammen med Jörn Renzenbrink . Han nåede sit højeste placeringer i verdens ranglister i 1992 med position 48 i single og i 1996 med position 233 i double.
I 1992 blev han udnævnt til det tyske Davis Cup- hold af holdkaptajn Nikola Pilić . Han spillede sit første spil som erstatning for den skadede Boris Becker i februar 1992 i første rundes møde mod Brasilien . Hans nederlag i fem sæt i en maratonkamp over 5 timer og 20 minutter mod Jaime Oncins betød eliminering af det tyske hold. To gange mere kom Zoecke som erstatning for Becker: i september 1992 besejrede han den belgiske Bart Wuyts tydeligt i to sæt i nedrykningsrunden , i februar 1995 tabte han den meningsløse kamp mod Goran Ivanišević i første rundes møde mod Kroatien .
Siden sin pensionering fra konkurrencesport har Zoecke kørt sit eget træningscenter i Rottach-Egern . Han kommenterer også tennisudsendelser for tv-stationen Eurosport . Siden 2011 har han været sportsdirektør for tennisskolen og siden 2013 også sportsdirektør for LTTC Rot-Weiß Berlin .